凝膠色譜不但可以用于分離測定高聚物的相對分子質量和相對分子質量分布，同時根據所用凝膠填料不同，可分離脂溶性和水溶性物質，分離相對分子質量的范圍從幾百萬到100以下。近年來，凝膠色譜也廣泛用于小分子化合物。相對分子質量相近而化學結構不同的物質，不可能通過凝膠滲透色譜法達到分離純化的目的。凝膠色譜不能分辨分子大小相近的化合物，相對分子質量相差需在10%以上才能得到分離。
凝膠滲透色譜是一個復雜的體系，需要考慮的問題很多。在這里我就凝膠滲透色譜柱使用分享給大家一些經驗：
色譜柱的安裝和使用
1.在連接色譜柱之前，預先用即將使用的流動相體系置換以前用的流動相體系。
2.在連接色譜柱時，要趕走因色譜柱保存不當或長時間不用在色譜柱的進口或者出口處產生的一些氣泡。
3.連接色譜柱要注意標示的色譜柱進出口方向。
4.如果分析所用的溫度較高，應在較低的流速下比如0.2到0.3ml/min的流速下緩慢地升高溫度，當溫度達到設定溫度后，再慢慢地增大流速至設定值。
5.如果色譜柱需要較長的時間才能平衡穩定，檢查色譜柱連接處是否有漏液。
凝膠滲透色譜柱的拆除和保存
1.完成實驗分析后，在0.2ml/min的流速下，緩慢將柱溫箱溫度降到室溫。
2.色譜柱降至室溫后，要快速地用堵頭將儀器上拆下的色譜柱密封好，避免柱子里面的流動相溢出。
3.將色譜柱放入到廠家提供的包裝盒中，放置在溫度變化很少的室內，恒溫是理想選擇。
4.凝膠滲透色譜柱柱子如長期不用，隔一段時間在儀器上沖洗一下，以確保柱子內的流動相不會揮發殆盡。
